中国疾病预防控制中心传染病预防控制所（以下简称传染病所）是中国疾病预防控制中心领导下的国家级细菌性传染病预防控制专业机构。

传染病所，前身为中央人民政府卫生部流行病学研究所。 1953年6月，中央人民政府政务院文化教育委员会批准成立了中央人民政府卫生部流行病学研究所（隶属卫生部），主要任务为加强侦察和防止帝国主义使用细菌武器，同时调查国内烈性传染病，采取预防措施。

1956年更名为北京流行病学研究所。

1957年-1958年，长春鼠疫防治所、大连生物制品研究所立克次体室、原协和医学院流行病科、医学科学院真菌研究室先后调至北京流行病学研究所，并更名为中国医学科学院流行病学微生物学研究所。

1971年，与中国医学科学院病毒研究所、放射所合并为中国医学科学院流行病防治研究所。

1979年中国医学科学院流行病防治研究所经重新调整，划分为中国医学科学院流行病学微生物学研究所和中国医学科学院病毒研究所。

后中国预防医学科学院成立，1986年更名为中国预防医学科学院流行病学微生物学研究所。2002年中国预防医学科学院改名为中国疾病预防控制中心，遂同期更名为中国疾病预防控制中心传染病预防控制所。